Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDXDC2PQ6P474 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDXDC2PQ6P474 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDXDC2PQ6P474 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDXDC2PQ6P474 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDXDC2PQ6P474 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDXDC2PQ6P474 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms