Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRGCQ6NXR0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRGCQ6NXR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IRGCQ6NXR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRGCQ6NXR0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRGCQ6NXR0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IRGCQ6NXR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms