Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL13AP3Q6NVV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL13AP3Q6NVV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL13AP3Q6NVV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms