Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CGB2Q6NT52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGB2Q6NT52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGB2Q6NT52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGB2Q6NT52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms