Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PCNX4Q63HM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PCNX4Q63HM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNX4Q63HM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCNX4Q63HM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNX4Q63HM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
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