Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DENND4CQ5VZ89 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DENND4CQ5VZ89 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DENND4CQ5VZ89 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DENND4CQ5VZ89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DENND4CQ5VZ89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms