Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf135Q5VTT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf135Q5VTT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf135Q5VTT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf135Q5VTT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms