Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q5VSD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q5VSD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5VSD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q5VSD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q5VSD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q5VSD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q5VSD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q5VSD8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5VSD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5VSD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5VSD8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q5VSD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5VSD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q5VSD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5VSD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5VSD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q5VSD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q5VSD8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q5VSD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q5VSD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q5VSD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms