Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LIN9Q5TKA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN9Q5TKA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN9Q5TKA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN9Q5TKA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LIN9Q5TKA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIN9Q5TKA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms