Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD3Q5JV73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD3Q5JV73 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FRMPD3Q5JV73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FRMPD3Q5JV73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FRMPD3Q5JV73 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FRMPD3Q5JV73 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms