Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MIA3Q5JRA6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MIA3Q5JRA6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MIA3Q5JRA6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MIA3Q5JRA6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MIA3Q5JRA6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms