Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1JQ5JR12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1JQ5JR12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1JQ5JR12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1JQ5JR12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1JQ5JR12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms