Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP8L3Q5GJ75 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP8L3Q5GJ75 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms