Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL22Q53GT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL22Q53GT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL22Q53GT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms