Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
KRTAP19-7Q3SYF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms