Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00303Q3SY05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC00303Q3SY05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC00303Q3SY05 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00303Q3SY05 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms