Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNPY1Q3B7I2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNPY1Q3B7I2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNPY1Q3B7I2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNPY1Q3B7I2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms