Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC96Q2M329 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC96Q2M329 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC96Q2M329 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC96Q2M329 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC96Q2M329 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC96Q2M329 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms