Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KNOP1Q1ED39 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNOP1Q1ED39 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNOP1Q1ED39 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms