Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LONRF1Q17RB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LONRF1Q17RB8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LONRF1Q17RB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF1Q17RB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF1Q17RB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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