Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA3Q16787 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMA3Q16787 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LAMA3Q16787 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMA3Q16787 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMA3Q16787 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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