Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA6Q16445 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA6Q16445 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRA6Q16445 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRA6Q16445 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms