Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNA6Q15825 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA6Q15825 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRNA6Q15825 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA6Q15825 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA6Q15825 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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