Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFNB3Q15768 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNB3Q15768 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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