Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEBPEQ15744 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEBPEQ15744 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEBPEQ15744 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CEBPEQ15744 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEBPEQ15744 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEBPEQ15744 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEBPEQ15744 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEBPEQ15744 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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