Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALX1Q15699 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALX1Q15699 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ALX1Q15699 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALX1Q15699 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ALX1Q15699 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALX1Q15699 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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