Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNHIT3Q15649 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNHIT3Q15649 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT3Q15649 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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