Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SKIV2LQ15477 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SKIV2LQ15477 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SKIV2LQ15477 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SKIV2LQ15477 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms