Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX1Q15475 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIX1Q15475 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SIX1Q15475 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIX1Q15475 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIX1Q15475 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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