Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23BQ15437 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC23BQ15437 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms