Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC23BQ15437 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC23BQ15437 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC23BQ15437 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC23BQ15437 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC23BQ15437 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
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