Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 49.59□□□□□ -0.878e-7■■■■■ 60.2
SF3B4Q15427 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 47.81□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 60.2
SF3B4Q15427 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 35.55□□□□□ -1.528e-7■■■■■ 60.2
SF3B4Q15427 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 221.26■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-214ENST00000508245 665 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-223ENST00000513101 564 ntTSL 47.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 ACSF2-217ENST00000510262 407 ntTSL 57.83□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 60.1
SF3B4Q15427 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.899e-10■■■■■ 60
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SF3B4Q15427 SHKBP1-221ENST00000599833 761 ntTSL 217.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 60
SF3B4Q15427 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 60
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SF3B4Q15427 SHKBP1-227ENST00000602011 897 ntTSL 516.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 60
SF3B4Q15427 SHKBP1-203ENST00000594298 716 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 60
SF3B4Q15427 SHKBP1-212ENST00000596163 785 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 60
SF3B4Q15427 SHKBP1-224ENST00000600718 1993 ntTSL 515.52■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 60
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SF3B4Q15427 CWF19L1-203ENST00000466955 659 ntTSL 32.66□□□□□ -1.983e-10■■■■■ 59.9
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SF3B4Q15427 ZNF224-204ENST00000589680 547 ntTSL 39.17□□□□□ -0.948e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.098e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 28.05□□□□□ -1.123e-20■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.428e-18■■■■■ 59.1
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SF3B4Q15427 ZNF224-205ENST00000589870 614 ntTSL 35.19□□□□□ -1.588e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 55.17□□□□□ -1.588e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.04□□□□□ -1.68e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 33.78□□□□□ -1.88e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 33.72□□□□□ -1.818e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CGGBP1-205ENST00000474441 717 ntTSL 23.14□□□□□ -1.918e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.02□□□□□ -1.938e-18■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 DCXR-217ENST00000582613 617 ntTSL 223.53■■□□□ 1.364e-9■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 519.67■□□□□ 0.744e-9■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 DCXR-219ENST00000584318 284 ntTSL 513.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-204ENST00000417438 548 ntTSL 415.25■□□□□ 0.038e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-209ENST00000435910 864 ntTSL 314.02□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-213ENST00000477268 589 ntTSL 412.76□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-211ENST00000463996 374 ntTSL 211.36□□□□□ -0.598e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.718e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-210ENST00000438440 783 ntTSL 310.57□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-222ENST00000495381 3993 ntTSL 29.42□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 59.1
SF3B4Q15427 CCDC14-216ENST00000483247 697 ntTSL 36.53□□□□□ -1.368e-8■■■■■ 59.1
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