Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TTF1Q15361 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TTF1Q15361 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TTF1Q15361 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TTF1Q15361 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TTF1Q15361 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
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