Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCN1Q15293 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCN1Q15293 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCN1Q15293 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN1Q15293 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN1Q15293 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms