Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCM1Q15154 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCM1Q15154 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCM1Q15154 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCM1Q15154 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
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