Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PCOLCEQ15113 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCOLCEQ15113 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCOLCEQ15113 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCOLCEQ15113 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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