Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RRS1Q15050 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RRS1Q15050 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
RRS1Q15050 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RRS1Q15050 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RRS1Q15050 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RRS1Q15050 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RRS1Q15050 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRS1Q15050 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRS1Q15050 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRS1Q15050 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
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