Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPHQ15003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCAPHQ15003 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCAPHQ15003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCAPHQ15003 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCAPHQ15003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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