Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF3Q14653 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IRF3Q14653 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRF3Q14653 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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