Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53BQ14153 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM53BQ14153 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53BQ14153 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53BQ14153 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM53BQ14153 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM53BQ14153 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM53BQ14153 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53BQ14153 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53BQ14153 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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