Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCINQ13939 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCINQ13939 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCINQ13939 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCINQ13939 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCINQ13939 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCINQ13939 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCINQ13939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCINQ13939 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCINQ13939 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCINQ13939 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCINQ13939 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCINQ13939 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCINQ13939 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCINQ13939 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCINQ13939 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCINQ13939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCINQ13939 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCINQ13939 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCINQ13939 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCINQ13939 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCINQ13939 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCINQ13939 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCINQ13939 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCINQ13939 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCINQ13939 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCINQ13939 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCINQ13939 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCINQ13939 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCINQ13939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCINQ13939 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCINQ13939 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCINQ13939 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCINQ13939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCINQ13939 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCINQ13939 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCINQ13939 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCINQ13939 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCINQ13939 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCINQ13939 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCINQ13939 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCINQ13939 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCINQ13939 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCINQ13939 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCINQ13939 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCINQ13939 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCINQ13939 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCINQ13939 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCINQ13939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCINQ13939 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCINQ13939 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCINQ13939 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCINQ13939 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCINQ13939 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCINQ13939 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCINQ13939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCINQ13939 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCINQ13939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCINQ13939 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCINQ13939 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCINQ13939 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCINQ13939 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCINQ13939 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCINQ13939 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCINQ13939 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCINQ13939 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCINQ13939 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCINQ13939 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCINQ13939 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCINQ13939 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCINQ13939 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCINQ13939 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
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