Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPSQ13938 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPSQ13938 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPSQ13938 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPSQ13938 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPSQ13938 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms