Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBA3CQ13748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBA3CQ13748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBA3CQ13748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBA3CQ13748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA3CQ13748 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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