Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TPBGQ13641 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGQ13641 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGQ13641 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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