Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB31Q13636 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB31Q13636 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB31Q13636 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB31Q13636 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms