Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIPK1Q13546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK1Q13546 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK1Q13546 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIPK1Q13546 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIPK1Q13546 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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