Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BFSP2Q13515 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BFSP2Q13515 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BFSP2Q13515 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BFSP2Q13515 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BFSP2Q13515 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BFSP2Q13515 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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