Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PDE3BQ13370 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDE3BQ13370 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDE3BQ13370 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PDE3BQ13370 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDE3BQ13370 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDE3BQ13370 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
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