Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA3BQ13214 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA3BQ13214 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA3BQ13214 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA3BQ13214 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA3BQ13214 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA3BQ13214 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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