Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF2Q12947 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF2Q12947 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXF2Q12947 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXF2Q12947 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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