Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXO1Q12778 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXO1Q12778 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO1Q12778 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXO1Q12778 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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